H Μερζιφούντα βρίσκεται σε μια εύφορη πεδιάδα στην οποία βρέθηκαν κατάλοιπα αρχαίων πολιτισμών όπως οι Φρύγες και οι Χετταίοι.

H Μερζιφούντα βρίσκεται σε μια εύφορη πεδιάδα στην οποία βρέθηκαν κατάλοιπα αρχαίων πολιτισμών όπως οι Φρύγες και οι Χετταίοι. 

Το όνομα της το πήρε από τους Βασιλιάδες του Ελληνιστικού Πόντου που είχαν την έδρα τους στην κοντινή Αμάσεια. Στα Βυζαντινά χρόνια ήταν ένα από τα κέντρα του περίφημου θέματος των Αρμενιακών που ονομάστηκε έτσι από την αναδιοργάνωση των λειψάνων του Ανατολικού Ρωμαϊκού στρατού ύστερα από τις μεγάλες καταστροφές του 7ου αιώνα. 

Στα Οθωμανικά χρόνια ο μισός πληθυσμός της πόλης αποτελούταν από Αρμένιους. Μάλιστα η αρχαιότητα της καταγωγής τους αποδεικνύεται από το γεγονός ότι εκεί βρισκόταν και μια από τις τελευταίες κοινότητες Αρμένιων Ζωροαστρών η οποία χάθηκε με τα γεγονότα της Γενοκτονίας των Αρμενίων. 

Στα νεότερα χρόνια, η Ελληνική κοινότητα αποτελούταν από 6 Ρωμαίικα χωριά στην γύρω περιοχή από έναν ενεργό πληθυσμό εντός της πόλης που έχτισε την εκκλησία της Αγίας Βαρβάρας το 1904 και είχε μάλιστα και ποδοσφαιρική ομάδα με το όνομα Πόντος. 

Πλέον, ανακαινισμένη, η εκκλησία λειτουργεί ως τόπος γαμήλιων τελετών αφού είχε χρησιμοποιηθεί για αρκετά χρόνια ως κινηματογράφος.